OS X El CapitanではCS6以下のバージョンについては動作保証外扱いですので、
動作する・しないは自己責任の範囲になります。
ソフトをアンインストールせずにOSのアップデートを行ったとしましたら、
一旦アンインストールしてCleaner Toolを実行してみたうえで
再インストールすると改善される可能性はあります。
(ただしそれについても自己責任です)
OS X El CapitanではCS6以下のバージョンについては動作保証外扱いですので、
動作する・しないは自己責任の範囲になります。
ソフトをアンインストールせずにOSのアップデートを行ったとしましたら、
一旦アンインストールしてCleaner Toolを実行してみたうえで
再インストールすると改善される可能性はあります。
(ただしそれについても自己責任です)