InDesignCS4 Mac環境です。
InDesignCS4で作成した部品（Illustratorで作成した画像のリンクや、文字が設定されています）をInDesignCS4のドキ ュメントに部品としてリンクさせた状態で、PDFを書き出すと部品内の画像が抜けてしまう事があります。
必ずというわけでは無く、何度かに一度発生する状態なので、画像のリンク切れやリンクデータが壊れているという事では無いかと思います。
自分が使用しているMacだけで発生するならば、Macのシステム自体の不安定など考えられたのですが、別Macでも同様の現象が出ており原因が分か りません。
※InDesignCS5やCS6では発生しません。
アドバイスや気になる事がありましたら教えて頂ければと思います。
よろしくお願いいたします。