環境設定のキャッシュフォルダーを削除することで消すことができます。
（下記はCS4/5の情報ですが、CS6でも同様です）
起動するとタスクバーに HWNDBasedPanelView UID:... がある（Windows 版 InDesign CS4/CS5）
ただし、一旦消しても使い続けることで再表示されます。
これは避けることができないので、定期的に処理するしかありません。
また、HWNDBasedPanelViewが表示されると、パネル類の表示が
正常にならなくなります（非表示のパネルが合体してしまうなど）。
これについては避けることができない状態です。