リンクパネルから透明画像へ移動をすると、ドキュメントの見開きの中の全然関係ないところに画像があり、削除することができました。落ちませんでした。
（同じ画像が2つあり、その内一つが見えない状態でした。見える画像は普通に削除しましたが、例の透明オブジェクトが残っていて、選択すると先に削除した画像と同じものでした。2つ作った記憶 はないので、ちょっと嫌な気分でした。）
たまに、ページパネルに斜線みたいなものが表示され、そのページにいくと、そこだけページの天地がものすごく広くなっていて、PDFに書き出すとそのページだけ落ちてしまうことがあります。
メモリをもっとつめ（現在iMacのため32G）ということだと解釈していましたが、
そのページを削除して新たにデータを作ることになります。（削除するときに、このページにはオブジェクトがあります。というメッセージが出ます。）タイムマシーンで一番近いデータをコピーする ことで対応していますが、タイムマシーンがなかったらと思うとかなり厳しいですね。
他の方にも同じような症状が出る方の意見も聞いてみたいです。
今回のご返答本当にありがとうございました。