業務終了のため帰宅してしまったので、月曜日の出社までInDesignを使用しての確認ができなくなってしまいました…
私のいままでの経験では、折込ページの扱いも様々でしたので、『結果的に「1枚＝１ページ」となる』場合以外は
「ページ番号とセクションの設定」と、自動ノンブルを削除したり、ノンブルを手打ちしたりして対応していました。
例 ： 『折込の両面を各2頁分に扱う』 と 『折込だが、全面大判写真なので１頁（表裏合わせて２頁）』 と
『折込の表面は2頁扱いだが裏面は白紙で、頁扱いしない』 が混在
質問の内容が少しタイトルと変わってしまいますので、タイトルを変えて新しく質問を立てる方が回答がつきやすいかもしれません。